Sariss Velkian a décidé de s'allier temporairement avec ses fidèles et l'APL, ainsi que l'Ordre Jedi. le plan de l'Empereur a été dévoilé et il s'avère qu'il a l'intention d'exterminer tous les utilisateurs de la Force sensible de la Galaxie. Ce qui correspondra à un massacre sans précédents.
L'Empereur compte utiliser sa puissance, combiné à 4 Holocrons de sa conception empli d'énergies de Noyau de la Force afin d'exécuter un rituel qui videra en un coup, la vitalité de tous les individus pouvant avoir le potentiel de ressentir la Force, formé ou non, à travers la galaxie à travers une sorte de vaste déchirure au coeur de la Force elle-même. Voulant devenir le seul et unique Maître des secrets de la Force et de ses possibilités, il n'épargnera aucune faction ni camp. pas même ses fidèles et ses Seigneurs.
Décidée à ne pas disparaître comme bien d'autres, la Seigneur de la Peur - Traditionaliste du contrôle et du pouvoir Sith sur la galaxie - préfère s'allier exceptionnellement jusqu'à ses plus grands adversaires pour le plus grand bien commun. l'Amiral Bivien Numb mobilise la Première Flotte de l'APL et mènera personnellement celle-ci au travers de route hyperspatiales du Noyau Profond de son époque en tant que contrebandier afin de lancer un vaste raid éclair sur Coruscant pour attaquer et éliminer l'Empereur. Ce dernier se trouvera à l'endroit d'un des nexus les plus puissants jamais enregistré : Le Temple Jedi.
Sariss Velkian fournira une flotte de combat fidèle envers sa personne et opposés aux projets révélés de l'Empereur. Maître Oreliana Irions a fait appel aux puissants guerrier Yuuzhan Vong. les Mandaloriens et les Soeurs de Dathomir participeront à cet affrontement pour renforcer l'équilibre des combats entre force user sur la planète. l'Empire de Fel et ses Chevaliers Impériaux se joindront également aux combats et accepteront temporairement la direction des opérations de l'Amiral pour la coordination et le passage sécurisé des nombreuses forces de manière à ne perdre aucun bâtiment et personnel durant la traversée.
Votre mission : Vous devez atteindre le Temple Jedi de Coruscant, trouver et éliminer l'Empereur une fois pour toutes. Une fois celui-ci trouvé, une partie des Jedi devront le combattre tandis que d'autres devront empêcher les renforts massifs potentiel de venir au secours de leur chef suprême. Sariss Velkian se joindra personnellement à vous pour renforcer le groupe d'assaut.